Den Code selber knacken

Wie viele Male haben Sie ihren Schülern schon erklärt, was ein Gen oder ein Protein ist? Einmal zu viel? Hier ein Vorschlag aus der Fachzeitschrift "Science in School": Das "Netherlands Institute of Ecology" hat ein Spiel kreiert, das Spielern erlaubt, den genetischen Code selber zu knacken. Eine knappe Viertelstunde dauert eine Basisversion des Spiels. Man kann das Spiel kaufen oder selber bauen.

Das Spiel handelt vom Bakterium Collimonas fungivorans, das die besondere Eigenschaft besitzt, Pilze zu verdauen. Ähnllich wie das Wörterspiel "Scrabble" besteht dieses Spiel aus Buchstaben. Allerdings nur aus jenen vier, die den genetischen Code ausmachen: A, C, G und T. Sie werden in Form von hölzernen Würfeln nebeneinander gelegt.

Als erstes gilt es, DNA-Fragmente aus dem Genom des Bakteriums zu einer längeren Sequenz zusammenzubauen. Dabei muss man den Blick schärfen für die sich überlappenden Sequenzen der einzelnen Stücke (Link zu verschiedenen Bildern).

Danach folgt die Translation, das Protein wird zusammengebaut. Auch hier wird mit Holzstücken gearbeitet, die jeweils eine Aminosäure repräsentieren. Finden sich in der DNA-Sequenz zum Beispiel die Buchstaben CCG, stehen diese für die Aminosäure Prolin, die in Form eines längeren Holstückes neben die drei Buchstaben gelegt wird. Die momentane Ausgabe des Spiels enthält weder mRNA noch RNA, diese werden jedoch ab Herbst 2007 erhältlich sein.

Ist die Protein sequenziert, wartet die letzte Herausforderung auf die Spieler: Sie müssen herausfinden, wie Collimonas seine aussergewöhnliche Nahrung verdauen kann (durch Vergleiche mit Proteinen anderer Organismen, deren Funktionen schon bekannt sind). Der Gedanke hinter dieser Aufgabe: Es nützt nichts, eine Proteinsequenz zu haben. Man muss wissen, wozu sie gut ist.

Quelle:

Johann Leveau: Fun with genomes: the Mycomuncher DNA Puzzle
Science in School, Issue 5, 2007

Links

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17. August 2007